MUFACE, per al compliment de les seues finalitats, compta anualment amb un pressupost, que l'any 2023 va ascendir a 1.938.944.570,00 €, que es finança amb les cotitzacions dels mutualistes, l'aportació de l'Estat, la subvenció de l'Estat (que fonamentalment finança el dèficit que anualment es produïx per a fer front a les prestacions de les mutualitats integrades en el Fons Especial), amb altres ingressos de diversa índole (rendiments de comptes i valors (*), ingressos patrimonials (**), etc.) i el romanent de tresoreria.
Les principals partides del pressupost d'ingressos de la Mutualitat contemplades en els pressupostos generals de l'Estat per a l'any 2023 (prorrogats) presenten el següent desglossament:
- Cotitzacions de mutualistes: 18,57%
- Aportació de l'Estat: 76,73%
- Subvenció de l'Estat: 3,51%
- Altres ingressos: 0,25%
- Romanent de tresoreria 0,94%
Per a fer front a les despeses de la seua acció protectora , MUFACE destina aproximadament el 83,33% del seu Pressupost a l'assistència sanitària i prestació farmacèutica, el 14,38% a les restants prestacions del Mutualisme Administratiu, el 1,50%, a les prestacions de les mutualitats integrades en el Fons Especial i el 0,79% a les despeses de funcionament.
El sistema de mutualisme administratiu configura esta composició dels ingressos de les mutualitats, de manera que una part menor prové de cotitzacions i una altra part major de l'aportació estatal (***)
(*) MUFACE és titular d'un compte de valors –patrimoni empresarial- integrada per accions i efectes procedents de les antigues mutualitats el patrimoni de les quals es va integrar en la Mutualitat per la Llei 29/1975, de Seguretat Social Funcionaris Civils de l'Estat. En este moment és gestionada per l'entitat BBVA amb base en el contracte subscrit per a serveis bancaris i està constituïda per uns títols de renda fixa afectes al Llegat Casat de la Font i altres de renda variable d'11 empreses diferents, que forma part i està afecte el seu rendiment al Fons Especial constituït amb l'aprovació de la Llei 29/1975. El seu valor apareix tots els anys en el Compte General de MUFACE
(**) Tal com apareix en la Memòria de MUFACE, pàg. 25, a data 31 de desembre de 2023 la Mutualitat és titular de la propietat de 78 immobles destinats a fi i ús públic (fons general) i de 129 immobles patrimonials procedents de les antigues mutualitats, el patrimoni de les quals es va integrar en la Mutualitat amb l'aprovació de la Llei 29/1975, de Seguretat Social dels Funcionaris Civils de l'Estat (fons especial). El rendiment dels últims esmentats està afecte al mateix Fons Especial.
(***). El finançament de l'assistència sanitària pública a Espanya, des de 1997, procedeix d'impostos de tots els contribuents. Per a més informació pot veure la pàgina web del Ministeri de Sanitat quant als fluxos de finançament en el Sistema Nacional de Salut al qual pertany MUFACE, on es veu eixe doble flux d'ingressos de les mutualitats de funcionaris (últim arxiu de la pàgina: Fluxos financers del sistema sanitari espanyol).