A la Secretaria General de MUFACE li corresponen les següents funcions:

a) L'assistència tècnica dels òrgans col·legiats de la Mutualitat

b) La conservació, intendència i funcionament dels edificis administratius, els serveis tècnics i de manteniment, els subministraments i adquisicions, el règim interior i els assumptes generals, així com l'inventari dels béns

c) La gestió dels recursos humans, l'execució dels plans de millora del rendiment, l'acció social i la formació del personal de la Mutualitat

d) La realització d'estudis, informes i documentació tècnica necessaris per a la gestió atribuïda a la Mutualitat, així com la preparació i tramitació de normes, instruccions i ordres de servei, el règim del col·lectiu i la informació administrativa en relació amb el camp d'aplicació del Mutualisme administratiu

e) L'elaboració i tramitació d'informes sobre els recursos i reclamacions sobre règim de MUFACE, així com del personal adscrit a la Mutualitat

f) La gestió dels béns immobles de les antigues Mutualitats integrades en MUFACE

g) L'elaboració i aplicació del pla informàtic, la gestió de la infraestructura tècnica i de comunicacions i de les tecnologies de la informació

h) Les relacions amb altres organismes i totes aquelles altres que no siguin específicament atribuïdes a altres Departaments