A Dirección Xeral de MUFACE asume a representación legal do Organismo, así como as competencias de dirección, coordinación, xestión e inspección das actividades desenvolvidas para o cumprimento dos fins daquel.
No plano central, a Dirección Xeral estrutúrase nos seguintes órganos:
Ademais, existe unha Unidade de Apoio á Dirección Xeral de MUFACE, encargada de dar soporte técnico á mesma, na que se integra a unidade de xestión do Plan de Pensións da Administración Xeral do Estado e unha Unidade de Tecnoloxías da Información e Comunicacións (TIC), que presta servizos ao organismo neste ámbito.
No plano periférico, e de acordo con a distribución do colectivo de mutualistas e beneficiarios por todo o territorio nacional, MUFACE conta cun Servizo Provincial en cada unha das Provincias, así como en Ceuta e Melilla. Ademais, existen dúas Oficinas Delegadas en Santiago de Compostela e Vigo.
Nesta etapa, os Directores e Directoras Provinciais cobran gran relevancia. O Plan MUFACE AVANZA asíntase sobre a existencia dun equipo directivo único, integrado por efectivos tanto dos servizos centrais como dos periféricos, polo que é necesario xerar unha cultura organizativa acorde con ese enfoque integrado e pór en marcha ferramentas que faciliten a coordinación funcional e territorial.
